不强制要求灭菌处理，但应防止二次污染的可能。移动式盛水器皿应每次使用前进行清洗、消毒、漂净，固定式供水管、饮水嘴应定期拆卸进行彻底清洗、消毒、漂净，方法同“盛水器皿(饮水盆、饮水瓶、瓶塞等)的清洗消毒”。
(二)清洁级及以上实验动物饮用水应经过灭菌处理
一般采用高压蒸汽灭菌和过滤除菌两种处理方法。
1.高压蒸汽灭菌操作程序
(1)高压灭菌的条件，根据灭菌器的机种、性能、容量大小，以及被灭菌饮水的量、容量、形状、污染程度等不同而不同，应采用“液体”灭菌模式。
(2)将耐高压蒸汽灭菌的清洁水瓶洗净后，装入饮水瓶容量80％的自来水(符合GB5479-2006标准)，盖上经清洗消毒过的饮水瓶塞，放入耐热性饮水瓶容器中。
(3)在饮水瓶的适当部位，贴上高压灭菌用颜色指示剂，并用铅笔注上日期、时间等。
(4)将装有水瓶的容器放入高压灭菌器，因为灭菌物是饮水(液体)，因此除此之外的东西(如垫料、饲料等)不能同时放入灭菌器一起灭菌。
(5)饮水的灭菌条件一般为121℃、40～50min。
(6)灭菌结束后，应慢慢排放蒸汽，灭菌30min以上的饮水，冷却时间要稍长一些，灭菌器门打开后，需静止片刻再取出，以防止沸水喷出。
(7)灭菌后的饮水放在固定的洁净场所保存，灭菌后及使用前应检查颜色指示剂的灭菌程度。
(8)用规定记录纸记录高压灭菌器处理的日期、时间、条件、操作者、被灭菌物的种类和数量等。
2.过滤除菌操作程序
(1)砂滤系统：采用石英砂介质过滤器，主要目的是去除原水中含有的泥沙、铁锈、胶体物质、悬浮物等颗粒在20μm以上对人体有害的物质，自动过滤系统可以自动(手动)进行反冲洗、正冲洗等一系列操作。
(2)活性炭吸附系统：采用活性炭过滤器，目的是为了去除水中的色素、异味、生化有机物、降低水的余氨值及农药污染和其他对人体有害的物质。自动过滤控制系统可以自动(手动)进行反冲洗、正冲洗等一系列操作。
(3)树脂交换系统：采用优质树脂对水进行软化，主要是降低水的硬度，去除水中的钙镁离子(水垢)并可进行智能化树脂再生。
(4)超滤系统：采用5μm孔径精密过滤器使水得到进一步的净化，使水的浊度和色度达到优化，保证RO系统安全的进水要求。
(5)反渗透系统：采用反渗透技术进行脱盐处理，去除钙、镁、铅、汞等对人体有害的重金属物质及其他杂质，降低水的硬度，脱盐率98％以上，生产出达到国家标准的纯净水。
(6)杀菌系统：采用紫外线杀菌器进行再次杀菌。
四、普通级实验动物饮用水质量检测
实验动物饮用水质量是指实验动物设施供水管网末梢水质状况。检测频率一般为每半年一次，特殊情况应增加检测频率。
(1)实验动物饮用水的标准检验方法采用《GB/T 5750.1-2006生活饮用水标准检验方法总则》。
(2)实验动物饮用水水样采集与保存采用《GB/T 5750.2-2006生活饮用水标准检验方法水样的采集和保存》。
(3)实验动物饮用水水质分析质量控制采用《GB/T 5750.3-2006生活饮用水标准检验方法水质分析质量控制》。
(4)实验动物饮用水感官性状和物理指标检测采用《GB/T 5750.4-2006生活饮用水标准检验方法感官性状和物理指标》。
(5)实验动物饮用水无机非金属指标检测采用《GB/T 5750.5-2006生活饮用水标准检验方法无机非金属指标》。
(6)实验动物饮用水金属指标检测采用《GB/T 5750.6-2006生活饮用水标准检验方法金属指标》。
(7)实验动物饮用水有机物指标检测采用《GB/T 5750.7-2006生活饮用水标准检验方法有机物综合指标》及《GB/T5750.8-2006生活饮用水标准检验方法有机物指标》。
(8)实验动物饮用水农药指标检测采用((GB/T 5750.9-2006生活饮用水标准检验方法农药指标》。
(9)实验动物饮用水消毒副产物指标检测采用((GB/T 5750.10-2006生活饮用水标准检验方法消毒副产物指标》。
(10)实验动物饮用水消毒剂指标检测采用(GB/T 5750.11-2006生活饮用水标准
检验方法消毒剂指标》。
(11)实验动物饮用水微生物指标检测采用《GB/T 5750.12-2006生活饮用水标准检验方法微生物指标》。
(12)实验动物饮用水放射性指标检测采用《GB/T 5750.13-2006生活饮用水标准检验方法放射性指标》。
五、清洁级及以上实验动物饮用水质量检测
屏障与隔离环境实验动物饮用水的微生物检测采用“无菌检查法”(《中国药典》，2010年版，三部附录)的方法，其他指标检测同“普通环境实验动物饮用水质量检测”。微生物指标检测一般每3个月一次，其他水质指标每半年一次。
六、灭菌效果评价
(一)普通环境实验动物饮用水评价
普通环境实验动物饮用水不强求进行灭菌处理，但供水机构应进行消毒处理，微生物指标应参考GB 5749-2006标准，不得含有病原微生物。
(二)屏障和隔离环境实验动物饮用水高压蒸汽灭菌效果评价
高压蒸汽灭菌效果的监测主要选用以下3种方法。
1.实时检测
实时检测，又称程序监测。根据安装在灭菌器上的量器(压力表、温度表、计时表)、图表、指示针、报警器等，指示灭菌设备工作正常与否。此法能迅速指出灭菌器的故障，但不能确定待灭菌物品是否达到灭菌要求。此法作为常规监测方法，每次灭菌均应进行并作相应记录。
2.化学指示监测
利用化学指示剂在一定温度与作用时间条件下受热变色或变形的特点，以判断是否达到灭菌所需参数。常用的有以下几种。
(1)自制测温管：将某些化学药物的晶体密封于小玻璃管内(长2cm，内径1～2mm)制成。常用试剂有苯甲酸(熔点121～123℃)等。灭菌时，当湿度上升至药物的熔点时，管内的晶体即熔化，灭菌完毕后虽冷却再凝固，其外形仍可与未熔化的晶体相区别，此法只能指示温度，不能指示热持续时间是否已达标，因此是最低标准。主要用于实验动物饮用水灭菌温度的监测。
(2)3M压力灭菌指示胶带：此胶带上印有斜形白色指示线条图案，是一种贴在待灭菌的无菌包外的特制变色胶纸。其粘贴面可牢固地固定于饮水瓶表面，在121℃、20min后，胶带100％变色(条纹图案即显现黑色斜条)。3M胶带既可用于实验动物饮用水灭菌温度的监测，又可在其表面填写灭菌日期、时间、保质期等内容。
3.生物指示剂监测
利用耐热的非致病性细菌芽胞作指示菌，以测定热力灭菌的效果。菌种用嗜热脂肪杆菌，本菌芽胞对热抗力较强，其热死亡时间与病原微生物中抗力最强的肉毒杆菌芽胞相似。生物指示剂有芽胞悬液、芽胞菌片及菌片与培养基混装的指示管。检测时应使用标准试验包，每个试验包中心部位放置生物指示剂2个，放在灭菌柜室的5个点，即上、中层的中央各一个点，下层的前、中、后各一个点。灭菌后，取出生物指示剂，接种于溴甲酚紫葡萄糖蛋白胨水培养基中，置55～60℃温箱中培养48h至7天，观察最终结果。若培养后颜色未变，澄清透明，说明芽胞已被杀灭，达到了灭菌要求。若变为黄色浑浊，说明芽胞未被杀灭，灭菌失败。
(三)屏障和隔离环境实验动物饮用水过滤除菌效果评价
实验动物饮用水过滤除菌效果评价同样采用“无菌检查法”(《中国药典》，2010年版，三部附录)，经细菌培养不得有任何细菌生长方为合格。
